Die pädagogischen Mitarbeiter*innen der Eylardus-Schule unterstüzen die Lehrer*innen und die Schüler*innen im Unterricht. Die Unterstützung kann im Klassenverband stattfinden oder in einer Kleingruppe mit einzelnen Schüler*innen, um diesen bei  ihren Aufgaben zur Seite zu stehen. Durch die Unterrichtsbegleitung arbeiten Lehrer*innen und Erzieher*innen noch enger zusammen, um die Kinder optimal zu fördern und zu fordern. Die pädagogischen Mitarbeiter*innen haben somit die Möglichkeit, die Kinder und Jugendlichen im Unterrichtsgeschehen kennen zu lernen und ihre Leistungen besser einschätzen zu können. Durch diese Präsenz im Unterricht wird zudem die Beziehung zu den Kindern intensiviert.